Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms