Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms