Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms