Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMD3Q96D46 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NMD3Q96D46 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NMD3Q96D46 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NMD3Q96D46 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
NMD3Q96D46 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NMD3Q96D46 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NMD3Q96D46 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NMD3Q96D46 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NMD3Q96D46 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NMD3Q96D46 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NMD3Q96D46 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NMD3Q96D46 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NMD3Q96D46 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms