Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL4Q96C24 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL4Q96C24 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms