Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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BEST4Q8NFU0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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BEST4Q8NFU0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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BEST4Q8NFU0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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BEST4Q8NFU0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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BEST4Q8NFU0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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BEST4Q8NFU0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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