Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms