Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms