Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms