Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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