Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms