Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms