Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPX1

TBC1D3C, TBC1 domain family member 3C, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3CQ6IPX1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBC1D3CQ6IPX1 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms