Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms