Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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