Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms