Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms