Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms