Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms