Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms