Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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CHD4Q14839 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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CHD4Q14839 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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