Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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GTF2H3Q13889 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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GTF2H3Q13889 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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GTF2H3Q13889 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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GTF2H3Q13889 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms