Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOFQ13790 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOFQ13790 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOFQ13790 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOFQ13790 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOFQ13790 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOFQ13790 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOFQ13790 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOFQ13790 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
APOFQ13790 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOFQ13790 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOFQ13790 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms