Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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NAE1Q13564 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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NAE1Q13564 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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NAE1Q13564 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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NAE1Q13564 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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NAE1Q13564 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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NAE1Q13564 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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NAE1Q13564 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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NAE1Q13564 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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NAE1Q13564 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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NAE1Q13564 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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