Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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TUBB3Q13509 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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TUBB3Q13509 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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TUBB3Q13509 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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TUBB3Q13509 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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