Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AL590240.2-201ENST00000413370 894 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC025419.1-202ENST00000535315 744 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 TMEM126A-201ENST00000304511 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 TRAF3IP3-201ENST00000367023 1065 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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MKRN4PQ13434 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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MKRN4PQ13434 AC131902.1-201ENST00000521558 594 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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MKRN4PQ13434 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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MKRN4PQ13434 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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MKRN4PQ13434 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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MKRN4PQ13434 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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MKRN4PQ13434 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 RPS20P22-202ENST00000488192 1318 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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