Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCOF1Q13428 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCOF1Q13428 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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