Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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