Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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