Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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SP140Q13342 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP140Q13342 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP140Q13342 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP140Q13342 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SP140Q13342 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP140Q13342 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP140Q13342 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP140Q13342 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP140Q13342 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP140Q13342 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP140Q13342 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SP140Q13342 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SP140Q13342 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP140Q13342 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SP140Q13342 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP140Q13342 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SP140Q13342 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP140Q13342 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SP140Q13342 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SP140Q13342 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SP140Q13342 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP140Q13342 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SP140Q13342 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SP140Q13342 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP140Q13342 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP140Q13342 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP140Q13342 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP140Q13342 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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