Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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SKP2Q13309 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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SKP2Q13309 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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SKP2Q13309 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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SKP2Q13309 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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SKP2Q13309 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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SKP2Q13309 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SKP2Q13309 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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