Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME3Q13232 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME3Q13232 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME3Q13232 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME3Q13232 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME3Q13232 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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