Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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CHAF1BQ13112 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CHAF1BQ13112 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CHAF1BQ13112 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CHAF1BQ13112 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CHAF1BQ13112 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CHAF1BQ13112 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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