Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms