Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PTPN13Q12923 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PTPN13Q12923 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PTPN13Q12923 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PTPN13Q12923 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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