Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TROQ12816 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TROQ12816 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TROQ12816 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TROQ12816 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TROQ12816 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TROQ12816 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TROQ12816 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TROQ12816 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TROQ12816 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TROQ12816 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TROQ12816 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TROQ12816 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TROQ12816 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TROQ12816 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TROQ12816 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TROQ12816 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TROQ12816 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TROQ12816 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TROQ12816 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TROQ12816 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TROQ12816 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TROQ12816 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TROQ12816 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TROQ12816 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TROQ12816 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TROQ12816 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TROQ12816 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TROQ12816 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TROQ12816 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TROQ12816 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TROQ12816 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TROQ12816 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TROQ12816 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TROQ12816 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TROQ12816 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TROQ12816 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TROQ12816 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TROQ12816 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TROQ12816 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TROQ12816 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TROQ12816 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TROQ12816 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TROQ12816 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TROQ12816 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TROQ12816 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TROQ12816 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TROQ12816 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TROQ12816 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TROQ12816 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TROQ12816 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TROQ12816 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TROQ12816 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TROQ12816 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TROQ12816 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TROQ12816 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TROQ12816 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TROQ12816 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TROQ12816 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TROQ12816 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TROQ12816 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TROQ12816 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TROQ12816 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TROQ12816 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TROQ12816 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TROQ12816 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TROQ12816 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TROQ12816 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TROQ12816 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TROQ12816 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TROQ12816 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TROQ12816 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TROQ12816 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TROQ12816 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
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