Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms