Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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