Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms