Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 TXK-203ENST00000507351 1153 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC048382.1-201ENST00000542197 1018 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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TNP2Q05952 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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TNP2Q05952 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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TNP2Q05952 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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TNP2Q05952 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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TNP2Q05952 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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