Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms