Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XPCQ01831 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
XPCQ01831 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
XPCQ01831 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
XPCQ01831 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
XPCQ01831 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
XPCQ01831 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
XPCQ01831 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPCQ01831 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms