Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms