Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms