Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms