Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CCL8P80075 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CCL8P80075 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CCL8P80075 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CCL8P80075 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CCL8P80075 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CCL8P80075 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CCL8P80075 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CCL8P80075 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL8P80075 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL8P80075 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL8P80075 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL8P80075 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL8P80075 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL8P80075 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL8P80075 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL8P80075 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL8P80075 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL8P80075 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL8P80075 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL8P80075 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL8P80075 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL8P80075 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL8P80075 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL8P80075 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL8P80075 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL8P80075 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL8P80075 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL8P80075 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL8P80075 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL8P80075 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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