Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms