Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP54P61011 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP54P61011 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRP54P61011 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRP54P61011 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRP54P61011 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRP54P61011 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRP54P61011 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRP54P61011 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRP54P61011 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRP54P61011 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRP54P61011 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP54P61011 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP54P61011 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP54P61011 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP54P61011 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP54P61011 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP54P61011 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP54P61011 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP54P61011 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP54P61011 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP54P61011 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP54P61011 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP54P61011 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP54P61011 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP54P61011 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP54P61011 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP54P61011 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP54P61011 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP54P61011 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP54P61011 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP54P61011 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP54P61011 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP54P61011 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms