Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00315P59091 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms