Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL3P58872 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms